肝活检是一项有损伤的侵入性检查，有一定的危险性和并发症发生率，并且存在抽样误差，故应严格掌握适应证和禁忌证，并做好充分的术前准备。肝活检的并发症相对少见，主要包括误伤邻近器官(如穿透胆囊、右侧胸腔、结肠或肾脏)和肝内损伤(如肝内血肿、胆道出血或动静脉瘘)。
检查前
首先，医生应明确检查目的，与患者和家属充分沟通，告知其肝穿刺活检的必要性、利益和风险，获得其知情同意。其次，所有患者均需评估停用抗凝药的风险，以及肝活检术中及术后的潜在出血风险。通常，在术前应停用抗血小板药物和抗凝药物，停药时间取决于患者的具体病情、所用药物种类，以及肝活检时潜在的出血风险。华法林通常需停用5天以上，肝素类药物需停用12～24小时。肝活检术后48～72小时可以开始应用抗血小板药物，术后第2天可应用华法林。
检查中
肝活检术应由具备丰富操作经验和能处理各种并发症的医生操作，需有专门的操作室，且具备足够空间。最好通过B超定位最佳穿刺点，以降低并发症的发生风险。术中使用镇静药物是安全的，不会增加操作风险。鉴于非肿瘤性弥漫性肝病的诊断、分级和分期有赖于足够大小的肝组织，故宜使用16G的活检针，并获得2厘米以上长度的肝组织标本。
检查后
密切监测患者的生命体征，每15分钟测量1次血压和心率，至少持续1小时。
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