医院结直肠肛门科（马应龙肛肠诊疗中心）是由医院和马应龙肛肠诊疗技术研医院共同建设的肛肠特色诊疗中心。
诊疗中心品牌实力雄厚，肛肠诊疗中心将充分发挥马应龙多年的老字号品牌优势，以医院的专家技术团队为核心，为衢州市及闽浙赣皖四省边际市县人民群众肛肠疾病患者提供整套肛肠病的诊疗服务。
诊疗中心技术力量强大，科主任毛晓伟是浙江省医学龙头学科（临床肿瘤学）学科带头人、中国第二届人民好医生，担任中华中医药学会肛肠分会常务理事、衢州市医学会肛肠分会委员。中心依托马应龙雄厚的技术资源优势，全国知名肛肠专家教医院的专家会定期来院区坐诊、开展手术、组织专家讲座和学术交流等活动，快速提升科室技术服务能力，为衢州市及闽浙赣皖四省边际市县群众的肛肠健康保驾护航。
诊疗中心设备先进，马应龙肛肠诊疗中心是目前衢州市唯一可以开展全医院，目前可开展“数字化排粪造影”、“结肠运输试验”、“直肠腔内超声”、“盆底肌电图”、“肛肠压力测定”、“电子结肠镜检查”、“生物反馈治疗”、“生物反馈评”、“大肠水疗”、“盆底CT”、“盆底核磁”等检查和治疗项目。
诊疗中心技术全面，以肛肠科痔、瘘、裂、肿、脱、结直肠癌等常见病手术为主、以便秘的中西医综合治疗为特色，除了可开展内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛裂、肛周脓肿、直肠脱垂、骶前囊肿、顽固性便秘、结直肠癌等肛肠科常见病手术外，还开展有PPH、RPH、TST、经肛多普勒超声痔动脉结扎悬吊术、腹腔镜辅助下结直肠癌根治术等微创手术以及便秘、肛门湿疹的中西医综合诊疗。
医院马应龙肛肠诊疗中心致力于医院“三位一体”盆底功能障碍防治中心，其目标是以盆底病功能障碍防治为中心，以肛肠及便秘疾病为龙头，以非植入性骶神经刺激治疗为突破口，将12个备受郑州最好的白癜风医院北京白癫风医院治疗